在討論區中看到有人問，「如果將未烘焙的生豆拿來種植，是否會發芽？」，最簡單的回答雖然就是「不會」，因為理論上剝除了果殼（parcement）的話，就不會發芽，所以咖啡生豆都是出口前才除去果殼的；但實際的情況是，已脫殼的咖啡生豆有時還是會出現發芽的情況，至少在生產地要進行播種時，啡農會把雒子的硬殼脫去才放入泥中幫助種子發芽，因為若不突破內果皮，新芽就無法長出，因此內果殼在某個層面來說反而是累贅。
然而，從海外進口的生豆就必須另當別論。剝除果殼後，生豆短期間內的發芽率雖然很高，卻也容易造成胚芽乾掉。隨著時間經過，胚芽的發芽能力也會逐漸衰退，就算是帶有內果殼的阿拉比卡種在經過半年左右的時間，發芽率也會一路下滑，一直趨近於零。一般的生豆在剝除內果皮到出口這段期間為了避免發霉，都會將生豆乾燥，讓含水量低於12%，這也是為何我們看到的生豆幾乎都不會發芽的原因。
咖啡樹發芽所需的時間頗長，一般為期1~2個月，氣溫低的時候，或者在秋冬乾燥的季節，更需要近3個月的時間，才能看見小小的幼芽從土壤中露臉，此時幼芽前端的雙子葉部分仍處於被內果殼包覆的狀態，我們可以將此時的形狀想像為市場賣的「豆芽菜」。不過，咖啡芽可一點也不脆弱，咖啡豆所長出來的莖可是呈現挺立，且會向上直直生長。也因為這樣的形狀，讓這個階段的咖啡豆在中南美洲被稱為「Fosforo」（西班牙文的火柴）。咖啡芽繼續成長後，雙子葉就會突破內果皮現身，接著長出本葉，長成幼苗後，更被移植至莊園，栽培成為咖啡樹。
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